浄土真宗の北陸の拠点・吉崎御坊は本願寺第8世法主の蓮如があわら市にある北潟湖の吉崎山に築いた。

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　そんな吉崎御坊が勢力を拡大したのが加賀の守護大名の跡目争いです。守護大名の富樫政親は真宗高田派の支援を受ける弟の幸千代との争いに敗れ加賀を追われます。そんな政親は吉崎御坊の蓮如を頼り再び、守護大名に返り咲きます。

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　吉崎御坊は栄え人々が集まります。そんな吉崎御坊の勢力が拡大することを恐れた富樫政親は厳しく吉崎御坊を統制していきます。それに反発した吉崎御坊は富樫政親とその子を討ってしまいます。ここから加賀国は一向一揆の国となります。

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　そんな吉崎御坊の最大の敵は越前朝倉家でした。永正3年（1506年）とうとう越前朝倉軍と一向一揆が九頭竜川で激突しますが一向一揆勢は敗退。朝倉軍は吉崎御坊を焼き払います。

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​　その後。吉崎御坊は廃坊となり現在は浄土真宗東西両派によって管理されています。